Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp49Q6P9L4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp49Q6P9L4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp49Q6P9L4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms