Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BC061212Q6P8K3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BC061212Q6P8K3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BC061212Q6P8K3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.4 ms