Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rrp12Q6P5B0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Rrp12Q6P5B0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rrp12Q6P5B0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rrp12Q6P5B0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp12Q6P5B0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp12Q6P5B0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp12Q6P5B0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rrp12Q6P5B0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp12Q6P5B0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp12Q6P5B0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp12Q6P5B0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp12Q6P5B0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rrp12Q6P5B0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms