Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Rprd2Q6NXI6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Rprd2Q6NXI6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rprd2Q6NXI6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Rprd2Q6NXI6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms