Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HelbQ6NVF4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HelbQ6NVF4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HelbQ6NVF4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HelbQ6NVF4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms