Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mvb12bQ6KAU4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mvb12bQ6KAU4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mvb12bQ6KAU4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12bQ6KAU4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms