Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm4Q6IRU2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm4Q6IRU2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm4Q6IRU2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms