Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp11bQ6DFW5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp11bQ6DFW5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp11bQ6DFW5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms