Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep290Q6A078 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep290Q6A078 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep290Q6A078 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep290Q6A078 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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