Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PnkdQ69ZP3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PnkdQ69ZP3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PnkdQ69ZP3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms