Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Jmjd1cQ69ZK6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Jmjd1cQ69ZK6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Jmjd1cQ69ZK6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Jmjd1cQ69ZK6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Jmjd1cQ69ZK6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Jmjd1cQ69ZK6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Jmjd1cQ69ZK6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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