Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nlrp9bQ66X22 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp9bQ66X22 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nlrp9bQ66X22 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nlrp9bQ66X22 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms