Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CilpQ66K08 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CilpQ66K08 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CilpQ66K08 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms