Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q66JV7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q66JV7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q66JV7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q66JV7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q66JV7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q66JV7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q66JV7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q66JV7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q66JV7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q66JV7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q66JV7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q66JV7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q66JV7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q66JV7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q66JV7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q66JV7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q66JV7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q66JV7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q66JV7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q66JV7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Q66JV7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q66JV7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q66JV7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q66JV7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q66JV7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Q66JV7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q66JV7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q66JV7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q66JV7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q66JV7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q66JV7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q66JV7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q66JV7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q66JV7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q66JV7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q66JV7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q66JV7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q66JV7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q66JV7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q66JV7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q66JV7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q66JV7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q66JV7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q66JV7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q66JV7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q66JV7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q66JV7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q66JV7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q66JV7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q66JV7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q66JV7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Q66JV7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q66JV7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q66JV7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q66JV7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Q66JV7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q66JV7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q66JV7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q66JV7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q66JV7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q66JV7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q66JV7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q66JV7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q66JV7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q66JV7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q66JV7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q66JV7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q66JV7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Q66JV7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q66JV7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q66JV7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q66JV7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q66JV7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q66JV7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q66JV7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q66JV7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q66JV7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q66JV7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q66JV7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q66JV7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q66JV7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q66JV7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q66JV7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q66JV7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q66JV7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q66JV7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q66JV7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q66JV7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q66JV7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q66JV7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q66JV7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q66JV7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q66JV7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q66JV7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q66JV7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q66JV7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q66JV7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q66JV7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q66JV7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms