Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctnna3Q65CL1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctnna3Q65CL1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnna3Q65CL1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnna3Q65CL1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms