Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col4a5Q63ZW6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Col4a5Q63ZW6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a5Q63ZW6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a5Q63ZW6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms