Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CochQ62507 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CochQ62507 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CochQ62507 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CochQ62507 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CochQ62507 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CochQ62507 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CochQ62507 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CochQ62507 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CochQ62507 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CochQ62507 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CochQ62507 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CochQ62507 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CochQ62507 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CochQ62507 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CochQ62507 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CochQ62507 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CochQ62507 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CochQ62507 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CochQ62507 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CochQ62507 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CochQ62507 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CochQ62507 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CochQ62507 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CochQ62507 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CochQ62507 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CochQ62507 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CochQ62507 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CochQ62507 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CochQ62507 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CochQ62507 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CochQ62507 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CochQ62507 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CochQ62507 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CochQ62507 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CochQ62507 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CochQ62507 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CochQ62507 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CochQ62507 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CochQ62507 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CochQ62507 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CochQ62507 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CochQ62507 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CochQ62507 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CochQ62507 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CochQ62507 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CochQ62507 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CochQ62507 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CochQ62507 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CochQ62507 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CochQ62507 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CochQ62507 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CochQ62507 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CochQ62507 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CochQ62507 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CochQ62507 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CochQ62507 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CochQ62507 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CochQ62507 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CochQ62507 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CochQ62507 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CochQ62507 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CochQ62507 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CochQ62507 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CochQ62507 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CochQ62507 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CochQ62507 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CochQ62507 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CochQ62507 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CochQ62507 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CochQ62507 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CochQ62507 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CochQ62507 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CochQ62507 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CochQ62507 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CochQ62507 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CochQ62507 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CochQ62507 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CochQ62507 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CochQ62507 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CochQ62507 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CochQ62507 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CochQ62507 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CochQ62507 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CochQ62507 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CochQ62507 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CochQ62507 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CochQ62507 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CochQ62507 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CochQ62507 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CochQ62507 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CochQ62507 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CochQ62507 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CochQ62507 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CochQ62507 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CochQ62507 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CochQ62507 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CochQ62507 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CochQ62507 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CochQ62507 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms