Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Taf6Q62311 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Taf6Q62311 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Taf6Q62311 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms