Protein–RNA interactions for Protein: Q62252

Spa17, Sperm surface protein Sp17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spa17Q62252 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spa17Q62252 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spa17Q62252 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spa17Q62252 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Spa17Q62252 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spa17Q62252 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spa17Q62252 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spa17Q62252 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spa17Q62252 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spa17Q62252 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spa17Q62252 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spa17Q62252 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spa17Q62252 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spa17Q62252 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spa17Q62252 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spa17Q62252 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spa17Q62252 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spa17Q62252 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spa17Q62252 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms