Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Six1Q62231 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Six1Q62231 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Six1Q62231 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Six1Q62231 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Six1Q62231 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Six1Q62231 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Six1Q62231 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Six1Q62231 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six1Q62231 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Six1Q62231 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Six1Q62231 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six1Q62231 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six1Q62231 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six1Q62231 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Six1Q62231 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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