Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sycp1Q62209 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sycp1Q62209 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sycp1Q62209 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms