Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prm3Q62100 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prm3Q62100 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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