Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Odf1Q61999 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf1Q61999 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms