Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna11Q61716 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna11Q61716 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna11Q61716 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna11Q61716 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna11Q61716 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms