Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rad21Q61550 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rad21Q61550 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rad21Q61550 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rad21Q61550 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rad21Q61550 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rad21Q61550 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rad21Q61550 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rad21Q61550 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rad21Q61550 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rad21Q61550 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms