Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccne1Q61457 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccne1Q61457 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccne1Q61457 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccne1Q61457 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms