Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnna2Q61301 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctnna2Q61301 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctnna2Q61301 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms