Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mre11Q61216 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mre11Q61216 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mre11Q61216 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mre11Q61216 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms