Protein–RNA interactions for Protein: Q61093

Cybb, Cytochrome b-245 heavy chain, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CybbQ61093 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CybbQ61093 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CybbQ61093 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CybbQ61093 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CybbQ61093 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CybbQ61093 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CybbQ61093 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CybbQ61093 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CybbQ61093 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CybbQ61093 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CybbQ61093 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CybbQ61093 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CybbQ61093 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms