Protein–RNA interactions for Protein: Q60I26

Als2cl, ALS2 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2clQ60I26 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Als2clQ60I26 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Als2clQ60I26 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Als2clQ60I26 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Als2clQ60I26 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Als2clQ60I26 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Als2clQ60I26 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Als2clQ60I26 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Als2clQ60I26 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Als2clQ60I26 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Als2clQ60I26 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Als2clQ60I26 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Als2clQ60I26 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Als2clQ60I26 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms