Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Vdac1Q60932 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vdac1Q60932 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms