Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot7Q60809 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot7Q60809 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnot7Q60809 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot7Q60809 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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