Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zzef1Q5SSH7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zzef1Q5SSH7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Zzef1Q5SSH7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms