Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS00

Zdbf2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdbf2Q5SS00 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zdbf2Q5SS00 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zdbf2Q5SS00 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zdbf2Q5SS00 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zdbf2Q5SS00 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zdbf2Q5SS00 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zdbf2Q5SS00 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms