Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRX1

Tom1l2, TOM1-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l2Q5SRX1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tom1l2Q5SRX1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tom1l2Q5SRX1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tom1l2Q5SRX1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tom1l2Q5SRX1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tom1l2Q5SRX1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tom1l2Q5SRX1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tom1l2Q5SRX1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tom1l2Q5SRX1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tom1l2Q5SRX1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tom1l2Q5SRX1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tom1l2Q5SRX1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms