Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf215Q5SPX3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf215Q5SPX3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf215Q5SPX3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.1 ms