Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc85aQ5SP85 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc85aQ5SP85 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85aQ5SP85 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms