Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKS2

Smim7, Small integral membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim7Q5RKS2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim7Q5RKS2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim7Q5RKS2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smim7Q5RKS2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms