Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PkdccQ5RJI4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PkdccQ5RJI4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PkdccQ5RJI4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PkdccQ5RJI4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms