Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CoblQ5NBX1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CoblQ5NBX1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CoblQ5NBX1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CoblQ5NBX1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms