Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nlrc3Q5DU56 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nlrc3Q5DU56 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc3Q5DU56 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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