Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam208bQ5DTT3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam208bQ5DTT3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam208bQ5DTT3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms