Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp13Q5BKP2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms