Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1qtnf9Q4ZJN1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C1qtnf9Q4ZJN1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1qtnf9Q4ZJN1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C1qtnf9Q4ZJN1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms