Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN81

H2-Q2, Histocompatibility 2, Q region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q2Q4KN81 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q2Q4KN81 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q2Q4KN81 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q2Q4KN81 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms