Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Brinp3Q499E0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Brinp3Q499E0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Brinp3Q499E0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Brinp3Q499E0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brinp3Q499E0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms