Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx25Q3ZT31 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx25Q3ZT31 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx25Q3ZT31 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.2 ms