Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga1Q3V3R4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga1Q3V3R4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms