Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmub2Q3V209 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmub2Q3V209 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmub2Q3V209 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmub2Q3V209 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmub2Q3V209 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmub2Q3V209 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmub2Q3V209 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms