Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9Q3V038 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9Q3V038 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc9Q3V038 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms